En ese 2005 ingresa como gerenciador Carlos Granero, quien arma un equipo, con Castagno Suárez, Luciano Leguizamón, Zárate, el retorno al club de Cuenca, Bustamante, Oyola, que en el Apertura 2005 le alcanza para quedarse en la B Nacional. Al mismo tiempo, el club elaboró otros rendimientos de consideración. A los títulos ganados en fútbol, su disciplina más relevante, se le suman otros conseguidos en otros deportes como voleibol, básquet, hockey sobre césped, entre otros. El primer profesor en enseñarlo fue Roberto Negreiro y los deportistas que sobresalieron en esos tiempos, Juan Manuel Moreno, Juan Carlos Michelli, Juan Zanga, Miguel Genuth, entre otros. En aquel equipo, además, jugaban Herberto Fagnani, Edgar Parizzia, Juan Ruggia, Juan Carlos Gago y Carlos Palmintieri. El equipo, al ser el campeón vigente, inauguró la temporada en un marco atípico, siendo visitante del reciente incorporado a la liga San Lorenzo de Buenos Aires en el estadio de Obras Sanitarias en un partido correspondiente a la segunda fase del torneo, donde la fusión resultó vencida. La misma se insertó en el club en el marco de una gira de ese año por el sudeste asiático. En 1960, San Lorenzo se convirtió en el primer club Argentino en disputar la Copa Libertadores de América, donde fue eliminado en una polémica semifinal por Peñarol, en donde los dirigentes regalaron la localía en el tercer partido.
Luego la disciplina tuvo una práctica aislada, hasta que en 2005 se anotó en la ASBAL, para volver a afiliarse a la FEMEBAL en 2008. Ya en el 2011, San Lorenzo obtuvo la Copa de Clubes de Juveniles en Mar del Plata, los torneos Apertura y Clausura de la misma categoría, el Clausura de Juniors y, además, la Primera logró el ascenso a Tercera División. Desde 2007 hasta 2011, San Lorenzo ha participado ininterrumpidamente de la División de Honor (máximo nivel en la Federación Metropolitana), lo que constituye un récord en la historia del club. En 1936, el club alcanzó el Campeonato Nacional, uno de sus primeros grandes logros. El 22 de mayo de 1982 se jugó la fecha 15 del Campeonato de Primera B, Morón recibió en cancha de Huracán frente a una multitud ante el puntero San Lorenzo de Almagro (que hasta ese momento estaba invicto, con 9 victorias y 5 empates).